明洪武十四年(1381年)，朝廷命各州县划分里甲，城区称厢，农村称都，统称为里，每里各编10甲，每甲由11户组成。并编造以户为主，详列丁口、田产以及应负赋役的簿册4份，分存各级政府作征收赋役根据，命名为“黄册”。当时，新化编户21里，城区1里(在城厢)、农村20里。县西南为大阳乡，辖10里，县正南为永宁乡，辖7里，县东北为石马乡，辖3里。当时规定：十年令有司更定其册，省贫里，使其民附于近里，而析富里为二，以补原额。至万历十六年(1588年)编修县志时，大阳乡为11里，有一都、二都、三都、四都、五都、六都、七都、八都、上八都、九都、十都；永宁乡为6里，有一都、二都、下二都、三都、四都、八都；石马乡为3里，有二都、三都、五都。其中永宁乡有八都而无六、七都，石马乡有五都而无一都，大阳乡之八都、永宁乡之二都，又均分为上下两都。清康熙三十五年(1696年)，析石马三都一部分为石马一都，又将石马五都并入大阳一都，并增设在城二厢、在城三厢。大阳十一都、永宁五都四里。共26里，辖260甲。甲以序数为名。清代初年，地方政区的基层组织，仍沿袭明代的里甲制度。嗣以土地兼并过多，地粮随之转移，人丁迁徙频繁，致里甲无一定疆界，官兵诸多不便。因此，在康熙末年，根据自然地理形势，将全县编为128村(后洋溪村并入利村合为127村)，作为政区的基层组织。新编的自然村与原都甲的对应关系是：
在城厢：城中四关大阳一都：北太平村、潘洋村、澧溪村、蒋坪村、团山村、茅坪村、苏溪村、江东村、罗冲村。
大阳二都：三塘村、傅家村、鸡笼村、星塘村。
大阳三都：鹅塘村、乌石村。
大阳四都：长峰村、田心村、栗山村、丹桂村、大洋村、滑石村、思澧村、西太平村。
大阳五都：上下村、梅树村、北渡村、金滩村、石板村、西车田村、冷水村、炉观村、长寿村、芷溪村、石笋村。
大阳六都：青岗村、桃林村、古塘村、水东村、下庄村、水口村、小浪村。
大阳七都：利村、山前村、麻罗村、洋溪村。
大阳上八都：南烟村、珂溪村、南舆田村、潮水村、土桥村、税塘村、浪丝村。
大阳下八都：木山村、石槽村、连岩村、中原村、潮原村、龙溪村、潘溪村、球溪村、三尖村、小滩村、筱坪村。
大阳九都：西坪村、时竹村、虎寨村、当下村、麻溪村、黛水村、崇瓦村、柳筻村。

大阳十都：上渡村、下渡村、满竹村、化溪村、上连村、下连村、铁山村、花桥村、阳硐村、岩口村、永溪村、坪青村、沫矿村。

永宁一都：罗洪村、九龙村、灵真村、长鄄村。

永宁上二都：常福村、巴油村。
永宁下二都：石脚村、金凤村。
永宁三都：栗坪村、朴塘村。
永宁四都：龙源村、龙塘村、南坪村、高凤村。
永宁七都：文田村、锡溪村、奉家村。
永宁八都：金壁村、福田村。
石马一都：上庙村、下庙村、富溪村、白溪村。
石马二都：上乐村、下乐村、中乐村、北锡溪村、横溪村、楚良村、鹅溪村。

石马三都：蜈蚣村、虾溪村、大陂村、旧县村、株木村、赤石村、崇山村、吉庆村、陂头村、黄沙村、桃茶村、车田村、老油村、大江村。
此后在道光十二年(1832年)，崇瓦村分为崇溪、瓦窑村，全县又为128村。咸丰年间，为抵御太平军，新化设局办团练，以团统辖各村。同治元年(1862年)，正式将全县127村(在此之前，崇溪、瓦窑两村又合为一村)划为16团管辖。新化县清同治元年团村领属关系：
城厢团领4村：上渡村、上下村、梅树村、冷水村。安集团领6村：满竹村、化溪村、下连村、上连村、文清村、沫矿村。
大同团领15村：阳硐村、筱坪村、黛水村、时竹村、虎寨村、西坪村、当正村、麻溪村、崇瓦村、柳筻村、花桥村、岩口村、铁山村、永溪村、车田村。
遵路团领12村：中原村、潮源村、龙溪村、小滩村、球溪村、潘溪村、连岩村、三尖村、税塘村、浪丝村、石槽村、木山村。
亲睦团领10村：石笋村、南烟村、潮水村、珂溪村、水口村、龙塘村、土桥村、舆田村、南平村、龙源村。
敦信团领8村：古塘村、小浪村、桃林村、利村、水东村、时团村、金壁村、麻罗村。
永固团领11村：罗洪村、九龙村、金凤村、灵真村、石脚村、常福村、高凤村、巴油村、长鄄村、朴塘村、栗坪村。
中和团领5村：北渡村、金滩村、大洋村、下庄村、辅田村。
遵义团领8村：石板村、青岗村、长寿村、炉观村、思澧村、滑石村、芷溪村、山前村。
永靖团领4村：文田村、锡溪村、奉家村、福田村。
西成团领10村：鹅塘村、三塘村、星塘村、鸡笼村、傅家村、西平村

团山村、茅坪村、罗冲村、江东冲。
知方团领8村：蒋坪村、澧溪村、潘洋村、苏溪寻、下乐村、中乐村、上乐村、横溪村。
永安团领5村：长峰村、田心村、乌石村、栗山村、丹桂村。
时雍团领10村：白溪村、旧县村、株木村、大陂村、富溪村、鹅溪村、北锡溪村、楚良村、下庙村、上庙村。
永清团领4村：下渡村、虾溪村、蜈蚣村、赤石村。
兴让团领7村：崇山村、吉庆村、老油村、黄沙村、大江村、陂头村、桃茶村。
清宣统二年(1910年)新化设自治筹备处，开办自治研究所，改团村为乡、镇。凡人口超过5.5万的置镇，不足此数的置乡，共16乡、镇。即城厢和大同、永固、西成、时雍4镇及安集、遵路、亲睦、敦信、中和、遵义，永靖、永清、永安、知方、兴让11乡。领属关系与团村基本相同。
注：袁氏朋成户在明朝、清朝时期，属新化县太阳乡六都桃林村。